Manfaat pepaya untuk pencernaan adalah membantu membuat protein lebih mudah dicerna, karena terdapat enzim papain dalam kandungannya.

Dalam sebuah penelitian tahun 2013 oleh Claus Muss, dkk, menunjukan bahwa orang yang mengkonsumsi formula berbahan pepaya selama 40 hari mengalami perbaikan sembelit dan kembung secara signifikan.

Selain itu, benih dan bagian lain tanaman pepaya juga telah digunakan untuk mengobati bisul.

5. Mengurangi Risiko Penyakit Kanker

Penelitian tahun 2014 oleh Aneta Gajowik dan Małgorzata M Dobrzyńsk, menunjukan bahwa kandungan likopen dalam pepaya bermanfaat dalam mengurangi risiko kanker. Hal ini mungkin juga bermanfaat bagi orang yang sedang dirawat karena kanker.

Sebuah penelitian kecil tahun 2004 oleh F Marotta, dkk dari S. Giuseppe Hospital, Milan, pada orang dewasa lanjut usia dengan peradangan dan kondisi perut prakanker, pepaya yang difermentasi mengurangi kerusakan oksidatif.